Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNK4Q9NYG8 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNK4Q9NYG8 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNK4Q9NYG8 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNK4Q9NYG8 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNK4Q9NYG8 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNK4Q9NYG8 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNK4Q9NYG8 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNK4Q9NYG8 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNK4Q9NYG8 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms