Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXB0

MKS1, Meckel syndrome type 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1Q9NXB0 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MKS1Q9NXB0 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms