Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATG3Q9NT62 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms