Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms