Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM8Q9BZR9 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms