Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCGF6Q9BYE7 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms