Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HIGD2AQ9BW72 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms