Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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C9orf16Q9BUW7 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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C9orf16Q9BUW7 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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C9orf16Q9BUW7 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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C9orf16Q9BUW7 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
C9orf16Q9BUW7 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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C9orf16Q9BUW7 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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C9orf16Q9BUW7 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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C9orf16Q9BUW7 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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C9orf16Q9BUW7 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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C9orf16Q9BUW7 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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C9orf16Q9BUW7 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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