Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TINF2Q9BSI4 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TINF2Q9BSI4 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TINF2Q9BSI4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TINF2Q9BSI4 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TINF2Q9BSI4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TINF2Q9BSI4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TINF2Q9BSI4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TINF2Q9BSI4 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TINF2Q9BSI4 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TINF2Q9BSI4 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TINF2Q9BSI4 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TINF2Q9BSI4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TINF2Q9BSI4 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TINF2Q9BSI4 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TINF2Q9BSI4 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TINF2Q9BSI4 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TINF2Q9BSI4 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TINF2Q9BSI4 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TINF2Q9BSI4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TINF2Q9BSI4 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TINF2Q9BSI4 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TINF2Q9BSI4 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TINF2Q9BSI4 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TINF2Q9BSI4 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TINF2Q9BSI4 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TINF2Q9BSI4 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TINF2Q9BSI4 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TINF2Q9BSI4 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TINF2Q9BSI4 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TINF2Q9BSI4 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TINF2Q9BSI4 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TINF2Q9BSI4 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TINF2Q9BSI4 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TINF2Q9BSI4 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TINF2Q9BSI4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TINF2Q9BSI4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TINF2Q9BSI4 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TINF2Q9BSI4 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TINF2Q9BSI4 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms