Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 SLC25A25-203ENST00000373068 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 PERM1-202ENST00000433179 3340 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 PHYHIP-201ENST00000321613 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 TJAP1-201ENST00000259751 2720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 IFFO1-206ENST00000465801 2850 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 CA14-201ENST00000369111 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms