Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD2Q9BSE4 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms