Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms