Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VAT1Q99536 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms