Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYNGAP1Q96PV0 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYNGAP1Q96PV0 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SYNGAP1Q96PV0 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYNGAP1Q96PV0 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYNGAP1Q96PV0 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SYNGAP1Q96PV0 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SYNGAP1Q96PV0 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SYNGAP1Q96PV0 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms