Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC114Q96M63 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms