Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms