Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SUSD3Q96L08 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms