Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 EMBP1-203ENST00000622787 4235 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 STRN-201ENST00000263918 8168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 ABCA2-223ENST00000614293 8146 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 TFDP2-215ENST00000489671 9857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 KIAA1549-202ENST00000440172 12379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 CPPED1-202ENST00000381774 6273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 RAD1-203ENST00000382038 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 ZEB2-234ENST00000636413 8984 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 TIAM1-206ENST00000541036 7018 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 GTF2IP13-202ENST00000609439 10247 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 SYNRG-229ENST00000621136 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 NAV1-203ENST00000367302 9685 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 ERCC5-201ENST00000355739 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 GZF1-202ENST00000377051 4740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 PCDHGA6-201ENST00000517434 4775 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 NPAP1-201ENST00000329468 7526 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 TG-201ENST00000220616 8450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LINC00208Q96KT6 SERINC5-202ENST00000507668 6479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms