Protein–RNA interactions for Protein: Q96JT2

SLC45A3, Solute carrier family 45 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC45A3Q96JT2 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC45A3Q96JT2 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms