Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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SPTSSAQ969W0 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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SPTSSAQ969W0 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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SPTSSAQ969W0 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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SPTSSAQ969W0 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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SPTSSAQ969W0 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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SPTSSAQ969W0 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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SPTSSAQ969W0 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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SPTSSAQ969W0 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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SPTSSAQ969W0 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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