Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
USP9XQ93008 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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USP9XQ93008 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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USP9XQ93008 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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USP9XQ93008 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 MACROD2-204ENST00000407045 727 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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USP9XQ93008 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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USP9XQ93008 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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USP9XQ93008 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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USP9XQ93008 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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