Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms