Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EDAQ92838 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDAQ92838 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDAQ92838 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDAQ92838 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EDAQ92838 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EDAQ92838 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDAQ92838 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EDAQ92838 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EDAQ92838 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDAQ92838 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EDAQ92838 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDAQ92838 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDAQ92838 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDAQ92838 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EDAQ92838 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EDAQ92838 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EDAQ92838 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDAQ92838 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDAQ92838 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDAQ92838 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDAQ92838 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDAQ92838 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDAQ92838 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDAQ92838 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDAQ92838 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDAQ92838 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDAQ92838 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EDAQ92838 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDAQ92838 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDAQ92838 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDAQ92838 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDAQ92838 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDAQ92838 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDAQ92838 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDAQ92838 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDAQ92838 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDAQ92838 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDAQ92838 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDAQ92838 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDAQ92838 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDAQ92838 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDAQ92838 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDAQ92838 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDAQ92838 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDAQ92838 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDAQ92838 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDAQ92838 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDAQ92838 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDAQ92838 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDAQ92838 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDAQ92838 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDAQ92838 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EDAQ92838 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDAQ92838 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDAQ92838 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDAQ92838 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDAQ92838 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDAQ92838 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EDAQ92838 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDAQ92838 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDAQ92838 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDAQ92838 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDAQ92838 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EDAQ92838 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDAQ92838 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDAQ92838 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDAQ92838 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDAQ92838 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDAQ92838 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDAQ92838 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDAQ92838 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EDAQ92838 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDAQ92838 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDAQ92838 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDAQ92838 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDAQ92838 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EDAQ92838 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDAQ92838 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDAQ92838 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDAQ92838 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDAQ92838 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDAQ92838 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDAQ92838 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDAQ92838 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDAQ92838 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDAQ92838 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDAQ92838 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EDAQ92838 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDAQ92838 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDAQ92838 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDAQ92838 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EDAQ92838 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDAQ92838 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDAQ92838 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EDAQ92838 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDAQ92838 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDAQ92838 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDAQ92838 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDAQ92838 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms