Protein–RNA interactions for Protein: Q92616

GCN1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCN1Q92616 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GCN1Q92616 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
GCN1Q92616 MRPS31P4-202ENST00000613769 583 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GCN1Q92616 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCN1Q92616 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCN1Q92616 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCN1Q92616 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCN1Q92616 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCN1Q92616 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCN1Q92616 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCN1Q92616 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCN1Q92616 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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GCN1Q92616 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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GCN1Q92616 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCN1Q92616 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCN1Q92616 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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GCN1Q92616 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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GCN1Q92616 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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GCN1Q92616 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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GCN1Q92616 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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GCN1Q92616 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCN1Q92616 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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GCN1Q92616 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCN1Q92616 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCN1Q92616 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCN1Q92616 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCN1Q92616 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCN1Q92616 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GCN1Q92616 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
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GCN1Q92616 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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GCN1Q92616 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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GCN1Q92616 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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GCN1Q92616 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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GCN1Q92616 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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GCN1Q92616 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCN1Q92616 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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