Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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