Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TTC29Q8NA56 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TTC29Q8NA56 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TTC29Q8NA56 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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TTC29Q8NA56 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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TTC29Q8NA56 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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TTC29Q8NA56 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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TTC29Q8NA56 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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TTC29Q8NA56 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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TTC29Q8NA56 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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