Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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HDDC3Q8N4P3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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HDDC3Q8N4P3 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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