Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CLIP4Q8N3C7 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CLIP4Q8N3C7 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CLIP4Q8N3C7 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CLIP4Q8N3C7 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CLIP4Q8N3C7 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CLIP4Q8N3C7 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CLIP4Q8N3C7 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CLIP4Q8N3C7 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CLIP4Q8N3C7 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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CLIP4Q8N3C7 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CLIP4Q8N3C7 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CLIP4Q8N3C7 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CLIP4Q8N3C7 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CLIP4Q8N3C7 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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