Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLRP9Q7RTR0 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NLRP9Q7RTR0 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NLRP9Q7RTR0 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NLRP9Q7RTR0 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLRP9Q7RTR0 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLRP9Q7RTR0 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLRP9Q7RTR0 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLRP9Q7RTR0 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLRP9Q7RTR0 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLRP9Q7RTR0 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLRP9Q7RTR0 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLRP9Q7RTR0 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLRP9Q7RTR0 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLRP9Q7RTR0 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLRP9Q7RTR0 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLRP9Q7RTR0 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLRP9Q7RTR0 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLRP9Q7RTR0 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLRP9Q7RTR0 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLRP9Q7RTR0 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLRP9Q7RTR0 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLRP9Q7RTR0 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLRP9Q7RTR0 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLRP9Q7RTR0 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NLRP9Q7RTR0 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLRP9Q7RTR0 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLRP9Q7RTR0 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLRP9Q7RTR0 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLRP9Q7RTR0 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLRP9Q7RTR0 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLRP9Q7RTR0 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLRP9Q7RTR0 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLRP9Q7RTR0 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLRP9Q7RTR0 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NLRP9Q7RTR0 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLRP9Q7RTR0 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLRP9Q7RTR0 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLRP9Q7RTR0 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLRP9Q7RTR0 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NLRP9Q7RTR0 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLRP9Q7RTR0 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLRP9Q7RTR0 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLRP9Q7RTR0 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLRP9Q7RTR0 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLRP9Q7RTR0 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLRP9Q7RTR0 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLRP9Q7RTR0 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLRP9Q7RTR0 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLRP9Q7RTR0 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLRP9Q7RTR0 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLRP9Q7RTR0 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLRP9Q7RTR0 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLRP9Q7RTR0 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLRP9Q7RTR0 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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