Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL2

USP45, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 45, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP45Q70EL2 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP45Q70EL2 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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