Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
BEND4Q6ZU67 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms