Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC141Q6ZP82 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms