Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms