Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 COA4-201ENST00000355693 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 CDC23-201ENST00000394884 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 OR4A18P-201ENST00000529103 1088 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 AC011447.3-205ENST00000592022 1268 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 COA1-202ENST00000310564 1085 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 CARD8-224ENST00000522431 622 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 KCNIP4-204ENST00000382150 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 TMEM126A-201ENST00000304511 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LHX8Q68G74 PYM1-202ENST00000398213 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms