Protein–RNA interactions for Protein: Q66GS9

CEP135, Centrosomal protein of 135 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP135Q66GS9 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CEP135Q66GS9 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CEP135Q66GS9 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CEP135Q66GS9 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CEP135Q66GS9 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CEP135Q66GS9 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CEP135Q66GS9 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CEP135Q66GS9 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CEP135Q66GS9 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CEP135Q66GS9 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP135Q66GS9 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP135Q66GS9 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP135Q66GS9 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP135Q66GS9 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP135Q66GS9 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP135Q66GS9 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP135Q66GS9 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP135Q66GS9 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP135Q66GS9 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP135Q66GS9 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP135Q66GS9 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP135Q66GS9 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP135Q66GS9 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP135Q66GS9 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP135Q66GS9 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP135Q66GS9 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP135Q66GS9 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP135Q66GS9 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP135Q66GS9 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP135Q66GS9 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP135Q66GS9 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP135Q66GS9 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP135Q66GS9 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP135Q66GS9 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP135Q66GS9 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP135Q66GS9 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP135Q66GS9 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP135Q66GS9 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP135Q66GS9 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP135Q66GS9 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP135Q66GS9 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CEP135Q66GS9 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CEP135Q66GS9 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CEP135Q66GS9 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CEP135Q66GS9 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CEP135Q66GS9 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP135Q66GS9 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP135Q66GS9 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP135Q66GS9 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP135Q66GS9 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP135Q66GS9 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP135Q66GS9 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP135Q66GS9 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP135Q66GS9 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP135Q66GS9 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP135Q66GS9 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP135Q66GS9 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP135Q66GS9 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP135Q66GS9 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP135Q66GS9 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP135Q66GS9 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP135Q66GS9 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP135Q66GS9 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP135Q66GS9 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP135Q66GS9 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP135Q66GS9 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP135Q66GS9 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP135Q66GS9 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP135Q66GS9 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP135Q66GS9 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP135Q66GS9 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP135Q66GS9 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP135Q66GS9 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP135Q66GS9 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP135Q66GS9 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP135Q66GS9 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP135Q66GS9 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP135Q66GS9 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP135Q66GS9 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP135Q66GS9 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP135Q66GS9 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP135Q66GS9 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP135Q66GS9 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP135Q66GS9 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP135Q66GS9 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP135Q66GS9 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP135Q66GS9 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP135Q66GS9 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP135Q66GS9 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP135Q66GS9 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP135Q66GS9 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP135Q66GS9 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP135Q66GS9 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP135Q66GS9 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP135Q66GS9 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP135Q66GS9 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP135Q66GS9 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP135Q66GS9 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP135Q66GS9 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP135Q66GS9 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms