Protein–RNA interactions for Protein: Q5TC63

GRTP1, Growth hormone-regulated TBC protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRTP1Q5TC63 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRTP1Q5TC63 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRTP1Q5TC63 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRTP1Q5TC63 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRTP1Q5TC63 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRTP1Q5TC63 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRTP1Q5TC63 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GRTP1Q5TC63 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GRTP1Q5TC63 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GRTP1Q5TC63 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRTP1Q5TC63 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRTP1Q5TC63 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRTP1Q5TC63 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRTP1Q5TC63 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GRTP1Q5TC63 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRTP1Q5TC63 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRTP1Q5TC63 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRTP1Q5TC63 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRTP1Q5TC63 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GRTP1Q5TC63 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRTP1Q5TC63 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRTP1Q5TC63 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRTP1Q5TC63 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRTP1Q5TC63 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRTP1Q5TC63 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRTP1Q5TC63 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRTP1Q5TC63 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms