Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SAPCD1Q5SSQ6 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms