Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGS0

NEXMIF, Neurite extension and migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEXMIFQ5QGS0 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NEXMIFQ5QGS0 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
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