Protein–RNA interactions for Protein: Q5BLP8

C4orf48, Neuropeptide-like protein C4orf48, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48Q5BLP8 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 LINC00857-201ENST00000422847 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 SF3B6-201ENST00000233468 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 FAM126A-201ENST00000409763 616 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 GTF3AP6-201ENST00000432585 986 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 OR7E23P-201ENST00000435600 1048 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC008677.3-201ENST00000519146 666 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AL161747.2-201ENST00000535893 472 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC007611.1-202ENST00000564212 854 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 ZNF677-207ENST00000598806 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AL136141.1-201ENST00000605780 369 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC097478.1-206ENST00000513572 2010 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 FLNA-204ENST00000369856 8241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 TTC8-204ENST00000354441 1342 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms