Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ODF2Q5BJF6 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ODF2Q5BJF6 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms