Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SFT2D3Q587I9 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms