Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFA9Q16795 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms