Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
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ECM1Q16610 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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ECM1Q16610 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ECM1Q16610 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
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