Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
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ZNF239Q16600 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
ZNF239Q16600 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
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