Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SYPL1Q16563 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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