Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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CNGA3Q16281 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CNGA3Q16281 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CNGA3Q16281 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CNGA3Q16281 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CNGA3Q16281 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CNGA3Q16281 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CNGA3Q16281 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CNGA3Q16281 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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