Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRIK4Q16099 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK4Q16099 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17■□□□□ 0.31
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