Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CDK5R1Q15078 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms