Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAB3GAP1Q15042 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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RAB3GAP1Q15042 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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RAB3GAP1Q15042 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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RAB3GAP1Q15042 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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