Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AC007386.2-202ENST00000622718 1018 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAPTM4AQ15012 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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